Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID1P14543 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID1P14543 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID1P14543 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID1P14543 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NID1P14543 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID1P14543 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NID1P14543 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID1P14543 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID1P14543 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID1P14543 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NID1P14543 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID1P14543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID1P14543 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID1P14543 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID1P14543 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NID1P14543 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID1P14543 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID1P14543 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID1P14543 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID1P14543 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID1P14543 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID1P14543 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NID1P14543 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID1P14543 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID1P14543 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID1P14543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID1P14543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID1P14543 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID1P14543 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NID1P14543 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NID1P14543 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NID1P14543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NID1P14543 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NID1P14543 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NID1P14543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NID1P14543 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NID1P14543 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NID1P14543 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NID1P14543 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NID1P14543 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NID1P14543 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NID1P14543 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NID1P14543 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NID1P14543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NID1P14543 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NID1P14543 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NID1P14543 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NID1P14543 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NID1P14543 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NID1P14543 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NID1P14543 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NID1P14543 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NID1P14543 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NID1P14543 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NID1P14543 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NID1P14543 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NID1P14543 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NID1P14543 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NID1P14543 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NID1P14543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NID1P14543 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NID1P14543 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NID1P14543 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NID1P14543 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NID1P14543 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NID1P14543 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NID1P14543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NID1P14543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NID1P14543 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NID1P14543 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NID1P14543 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NID1P14543 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NID1P14543 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NID1P14543 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NID1P14543 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NID1P14543 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NID1P14543 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NID1P14543 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NID1P14543 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NID1P14543 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NID1P14543 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NID1P14543 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NID1P14543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NID1P14543 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NID1P14543 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NID1P14543 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NID1P14543 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NID1P14543 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NID1P14543 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NID1P14543 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NID1P14543 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NID1P14543 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NID1P14543 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NID1P14543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NID1P14543 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NID1P14543 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NID1P14543 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NID1P14543 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NID1P14543 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms