Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF35P13682 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF35P13682 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF35P13682 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF35P13682 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms