Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXD8P13378 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXD8P13378 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXD8P13378 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXD8P13378 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD8P13378 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD8P13378 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD8P13378 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXD8P13378 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXD8P13378 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD8P13378 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms