Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM18P0DKX4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM18P0DKX4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM18P0DKX4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM18P0DKX4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms