Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD9

PGA5, Pepsin A-5, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA5P0DJD9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PGA5P0DJD9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGA5P0DJD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGA5P0DJD9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA5P0DJD9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA5P0DJD9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms