Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM13P0DJ93 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM13P0DJ93 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM13P0DJ93 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM13P0DJ93 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM13P0DJ93 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms