Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM253P0C7T8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM253P0C7T8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM253P0C7T8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM253P0C7T8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms