Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L7P0C7H9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP17L7P0C7H9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L7P0C7H9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L7P0C7H9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L7P0C7H9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms