Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBBP07437 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBBP07437 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBBP07437 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBBP07437 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBBP07437 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBBP07437 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBBP07437 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBBP07437 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBBP07437 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBBP07437 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBBP07437 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBBP07437 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBBP07437 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBBP07437 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBBP07437 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TUBBP07437 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TUBBP07437 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBBP07437 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBBP07437 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBBP07437 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBBP07437 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBBP07437 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBBP07437 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBBP07437 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBBP07437 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBBP07437 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBBP07437 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBBP07437 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBBP07437 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBBP07437 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBBP07437 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBBP07437 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBBP07437 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBBP07437 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBBP07437 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBBP07437 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBBP07437 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBBP07437 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBBP07437 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBBP07437 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBBP07437 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUBBP07437 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBBP07437 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBBP07437 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBBP07437 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBBP07437 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBBP07437 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBBP07437 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBBP07437 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBBP07437 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBBP07437 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBBP07437 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBBP07437 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBBP07437 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBBP07437 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBBP07437 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBBP07437 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBBP07437 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBBP07437 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBBP07437 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBBP07437 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBBP07437 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBBP07437 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBBP07437 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBBP07437 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBBP07437 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBBP07437 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBBP07437 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBBP07437 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBBP07437 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBBP07437 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBBP07437 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBBP07437 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBBP07437 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBBP07437 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBBP07437 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBBP07437 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBBP07437 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBBP07437 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBBP07437 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBBP07437 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBBP07437 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBBP07437 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBBP07437 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBBP07437 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms