Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEFMP07197 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEFMP07197 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEFMP07197 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEFMP07197 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEFMP07197 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEFMP07197 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEFMP07197 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEFMP07197 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEFMP07197 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
NEFMP07197 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEFMP07197 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEFMP07197 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEFMP07197 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFMP07197 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFMP07197 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFMP07197 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEFMP07197 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFMP07197 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFMP07197 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEFMP07197 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEFMP07197 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEFMP07197 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NEFMP07197 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEFMP07197 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEFMP07197 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEFMP07197 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEFMP07197 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEFMP07197 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEFMP07197 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEFMP07197 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NEFMP07197 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEFMP07197 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEFMP07197 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEFMP07197 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEFMP07197 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEFMP07197 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEFMP07197 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEFMP07197 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEFMP07197 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEFMP07197 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NEFMP07197 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEFMP07197 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEFMP07197 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEFMP07197 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEFMP07197 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEFMP07197 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEFMP07197 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEFMP07197 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEFMP07197 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEFMP07197 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEFMP07197 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEFMP07197 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEFMP07197 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEFMP07197 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEFMP07197 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEFMP07197 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NEFMP07197 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NEFMP07197 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NEFMP07197 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEFMP07197 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEFMP07197 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NEFMP07197 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NEFMP07197 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NEFMP07197 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEFMP07197 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEFMP07197 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEFMP07197 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEFMP07197 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEFMP07197 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEFMP07197 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEFMP07197 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEFMP07197 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEFMP07197 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFMP07197 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFMP07197 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NEFMP07197 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEFMP07197 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEFMP07197 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NEFMP07197 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEFMP07197 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NEFMP07197 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NEFMP07197 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEFMP07197 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEFMP07197 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEFMP07197 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NEFMP07197 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEFMP07197 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEFMP07197 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFMP07197 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFMP07197 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFMP07197 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NEFMP07197 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms