Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F13BP05160 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F13BP05160 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F13BP05160 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
F13BP05160 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F13BP05160 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F13BP05160 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
F13BP05160 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F13BP05160 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F13BP05160 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F13BP05160 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F13BP05160 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F13BP05160 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F13BP05160 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F13BP05160 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F13BP05160 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F13BP05160 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F13BP05160 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F13BP05160 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F13BP05160 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F13BP05160 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F13BP05160 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F13BP05160 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F13BP05160 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
F13BP05160 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F13BP05160 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F13BP05160 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F13BP05160 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F13BP05160 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F13BP05160 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F13BP05160 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F13BP05160 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F13BP05160 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F13BP05160 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F13BP05160 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F13BP05160 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
F13BP05160 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F13BP05160 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F13BP05160 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F13BP05160 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
F13BP05160 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F13BP05160 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F13BP05160 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F13BP05160 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F13BP05160 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F13BP05160 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F13BP05160 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
F13BP05160 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F13BP05160 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F13BP05160 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F13BP05160 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F13BP05160 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F13BP05160 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F13BP05160 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F13BP05160 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F13BP05160 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F13BP05160 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F13BP05160 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F13BP05160 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
F13BP05160 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
F13BP05160 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F13BP05160 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F13BP05160 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F13BP05160 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F13BP05160 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F13BP05160 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F13BP05160 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F13BP05160 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F13BP05160 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F13BP05160 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
F13BP05160 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
F13BP05160 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F13BP05160 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13BP05160 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13BP05160 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F13BP05160 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F13BP05160 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
F13BP05160 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F13BP05160 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
F13BP05160 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13BP05160 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F13BP05160 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13BP05160 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F13BP05160 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms