Protein–RNA interactions for Protein: P04637

TP53, Cellular tumor antigen p53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53P04637 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP53P04637 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP53P04637 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53P04637 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP53P04637 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53P04637 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53P04637 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TP53P04637 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53P04637 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53P04637 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53P04637 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53P04637 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TP53P04637 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53P04637 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53P04637 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53P04637 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53P04637 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53P04637 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53P04637 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53P04637 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53P04637 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53P04637 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53P04637 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53P04637 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53P04637 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53P04637 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53P04637 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53P04637 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP53P04637 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP53P04637 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP53P04637 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP53P04637 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53P04637 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53P04637 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53P04637 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53P04637 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53P04637 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53P04637 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53P04637 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53P04637 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53P04637 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53P04637 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53P04637 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53P04637 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53P04637 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53P04637 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53P04637 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53P04637 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53P04637 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53P04637 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53P04637 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53P04637 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53P04637 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53P04637 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53P04637 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53P04637 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53P04637 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53P04637 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53P04637 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53P04637 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53P04637 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53P04637 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53P04637 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53P04637 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53P04637 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53P04637 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53P04637 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53P04637 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53P04637 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53P04637 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53P04637 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53P04637 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53P04637 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53P04637 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53P04637 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53P04637 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53P04637 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53P04637 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53P04637 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53P04637 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53P04637 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53P04637 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53P04637 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53P04637 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TP53P04637 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53P04637 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53P04637 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53P04637 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53P04637 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53P04637 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53P04637 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TP53P04637 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms