Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1P04632 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1P04632 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1P04632 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1P04632 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1P04632 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1P04632 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms