Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TK1P04183 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TK1P04183 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TK1P04183 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TK1P04183 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TK1P04183 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TK1P04183 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TK1P04183 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TK1P04183 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TK1P04183 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TK1P04183 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TK1P04183 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TK1P04183 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TK1P04183 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TK1P04183 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TK1P04183 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TK1P04183 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TK1P04183 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TK1P04183 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TK1P04183 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TK1P04183 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TK1P04183 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TK1P04183 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TK1P04183 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TK1P04183 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TK1P04183 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TK1P04183 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TK1P04183 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TK1P04183 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TK1P04183 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TK1P04183 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TK1P04183 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TK1P04183 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TK1P04183 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TK1P04183 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TK1P04183 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TK1P04183 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TK1P04183 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TK1P04183 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TK1P04183 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TK1P04183 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TK1P04183 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TK1P04183 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TK1P04183 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TK1P04183 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TK1P04183 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TK1P04183 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TK1P04183 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TK1P04183 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TK1P04183 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TK1P04183 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TK1P04183 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TK1P04183 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TK1P04183 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TK1P04183 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TK1P04183 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TK1P04183 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TK1P04183 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TK1P04183 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TK1P04183 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TK1P04183 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TK1P04183 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TK1P04183 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TK1P04183 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TK1P04183 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TK1P04183 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TK1P04183 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TK1P04183 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TK1P04183 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TK1P04183 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TK1P04183 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TK1P04183 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TK1P04183 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TK1P04183 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TK1P04183 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TK1P04183 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TK1P04183 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TK1P04183 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TK1P04183 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TK1P04183 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TK1P04183 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms