Protein–RNA interactions for Protein: P01583

IL1A, Interleukin-1 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1AP01583 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL1AP01583 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IL1AP01583 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1AP01583 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1AP01583 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IL1AP01583 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IL1AP01583 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IL1AP01583 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IL1AP01583 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IL1AP01583 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IL1AP01583 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IL1AP01583 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IL1AP01583 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IL1AP01583 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IL1AP01583 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IL1AP01583 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IL1AP01583 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL1AP01583 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL1AP01583 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL1AP01583 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL1AP01583 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL1AP01583 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IL1AP01583 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IL1AP01583 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IL1AP01583 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IL1AP01583 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IL1AP01583 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IL1AP01583 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IL1AP01583 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IL1AP01583 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IL1AP01583 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IL1AP01583 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IL1AP01583 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IL1AP01583 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IL1AP01583 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IL1AP01583 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IL1AP01583 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IL1AP01583 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IL1AP01583 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IL1AP01583 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IL1AP01583 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IL1AP01583 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IL1AP01583 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL1AP01583 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL1AP01583 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL1AP01583 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL1AP01583 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL1AP01583 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL1AP01583 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IL1AP01583 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL1AP01583 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL1AP01583 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL1AP01583 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1AP01583 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1AP01583 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1AP01583 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1AP01583 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1AP01583 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1AP01583 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1AP01583 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1AP01583 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1AP01583 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1AP01583 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1AP01583 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1AP01583 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1AP01583 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1AP01583 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1AP01583 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1AP01583 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1AP01583 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1AP01583 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1AP01583 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1AP01583 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1AP01583 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1AP01583 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1AP01583 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1AP01583 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1AP01583 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1AP01583 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1AP01583 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1AP01583 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1AP01583 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1AP01583 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1AP01583 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1AP01583 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1AP01583 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1AP01583 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IL1AP01583 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1AP01583 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms