Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTCP00480 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTCP00480 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTCP00480 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTCP00480 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OTCP00480 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTCP00480 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
OTCP00480 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTCP00480 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTCP00480 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTCP00480 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTCP00480 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTCP00480 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTCP00480 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OTCP00480 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTCP00480 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTCP00480 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTCP00480 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTCP00480 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTCP00480 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTCP00480 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTCP00480 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTCP00480 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTCP00480 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTCP00480 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OTCP00480 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTCP00480 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTCP00480 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTCP00480 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTCP00480 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTCP00480 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTCP00480 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTCP00480 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTCP00480 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OTCP00480 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTCP00480 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTCP00480 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTCP00480 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTCP00480 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTCP00480 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTCP00480 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTCP00480 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTCP00480 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTCP00480 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTCP00480 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTCP00480 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTCP00480 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTCP00480 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTCP00480 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OTCP00480 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTCP00480 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OTCP00480 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTCP00480 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTCP00480 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTCP00480 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTCP00480 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTCP00480 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTCP00480 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTCP00480 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTCP00480 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OTCP00480 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTCP00480 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTCP00480 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTCP00480 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTCP00480 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTCP00480 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OTCP00480 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
OTCP00480 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTCP00480 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTCP00480 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OTCP00480 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTCP00480 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTCP00480 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTCP00480 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTCP00480 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OTCP00480 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTCP00480 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OTCP00480 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTCP00480 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTCP00480 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTCP00480 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OTCP00480 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTCP00480 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTCP00480 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTCP00480 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTCP00480 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTCP00480 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTCP00480 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTCP00480 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTCP00480 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTCP00480 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTCP00480 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTCP00480 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms