Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-2O95096 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX2-2O95096 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX2-2O95096 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX2-2O95096 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-2O95096 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-2O95096 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-2O95096 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-2O95096 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX2-2O95096 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX2-2O95096 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX2-2O95096 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms