Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
USP19O94966 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
USP19O94966 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
USP19O94966 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
USP19O94966 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
USP19O94966 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
USP19O94966 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
USP19O94966 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
USP19O94966 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
USP19O94966 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP19O94966 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP19O94966 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
USP19O94966 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
USP19O94966 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
USP19O94966 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
USP19O94966 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
USP19O94966 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
USP19O94966 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
USP19O94966 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
USP19O94966 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
USP19O94966 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
USP19O94966 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
USP19O94966 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
USP19O94966 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
USP19O94966 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP19O94966 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP19O94966 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
USP19O94966 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP19O94966 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP19O94966 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP19O94966 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP19O94966 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP19O94966 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
USP19O94966 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP19O94966 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP19O94966 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP19O94966 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP19O94966 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP19O94966 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP19O94966 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
USP19O94966 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
USP19O94966 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
USP19O94966 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
USP19O94966 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
USP19O94966 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
USP19O94966 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
USP19O94966 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
USP19O94966 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
USP19O94966 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
USP19O94966 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP19O94966 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP19O94966 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP19O94966 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP19O94966 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP19O94966 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
USP19O94966 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP19O94966 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP19O94966 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP19O94966 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
USP19O94966 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
USP19O94966 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
USP19O94966 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
USP19O94966 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
USP19O94966 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
USP19O94966 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
USP19O94966 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
USP19O94966 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
USP19O94966 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
USP19O94966 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
USP19O94966 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP19O94966 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP19O94966 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
USP19O94966 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
USP19O94966 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
USP19O94966 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP19O94966 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP19O94966 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP19O94966 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP19O94966 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP19O94966 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP19O94966 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
USP19O94966 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
USP19O94966 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
USP19O94966 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
USP19O94966 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
USP19O94966 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
USP19O94966 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
USP19O94966 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
USP19O94966 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
USP19O94966 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
USP19O94966 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP19O94966 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP19O94966 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP19O94966 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
USP19O94966 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
USP19O94966 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
USP19O94966 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
USP19O94966 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
USP19O94966 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
USP19O94966 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms