Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
KIAA0556O60303 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.12■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
KIAA0556O60303 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KIAA0556O60303 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
KIAA0556O60303 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KIAA0556O60303 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
KIAA0556O60303 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
KIAA0556O60303 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
KIAA0556O60303 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
KIAA0556O60303 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
KIAA0556O60303 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
KIAA0556O60303 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
KIAA0556O60303 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
KIAA0556O60303 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.73■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
KIAA0556O60303 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
KIAA0556O60303 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
KIAA0556O60303 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms