Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF12O43508 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF12O43508 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF12O43508 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF12O43508 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF12O43508 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF12O43508 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF12O43508 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF12O43508 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF12O43508 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF12O43508 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF12O43508 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF12O43508 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF12O43508 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF12O43508 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF12O43508 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF12O43508 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF12O43508 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF12O43508 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF12O43508 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF12O43508 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF12O43508 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF12O43508 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF12O43508 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF12O43508 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF12O43508 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF12O43508 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TNFSF12O43508 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF12O43508 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms