Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-8O15522 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX2-8O15522 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-8O15522 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKX2-8O15522 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX2-8O15522 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX2-8O15522 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms