Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN3O14994 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN3O14994 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN3O14994 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN3O14994 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYN3O14994 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYN3O14994 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN3O14994 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN3O14994 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN3O14994 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYN3O14994 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYN3O14994 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYN3O14994 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN3O14994 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN3O14994 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN3O14994 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN3O14994 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYN3O14994 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYN3O14994 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYN3O14994 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYN3O14994 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN3O14994 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN3O14994 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN3O14994 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN3O14994 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN3O14994 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN3O14994 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN3O14994 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN3O14994 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN3O14994 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYN3O14994 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYN3O14994 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYN3O14994 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYN3O14994 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN3O14994 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN3O14994 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYN3O14994 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYN3O14994 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYN3O14994 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYN3O14994 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN3O14994 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN3O14994 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN3O14994 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN3O14994 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN3O14994 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN3O14994 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN3O14994 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYN3O14994 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYN3O14994 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYN3O14994 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYN3O14994 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYN3O14994 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYN3O14994 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN3O14994 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN3O14994 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN3O14994 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYN3O14994 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN3O14994 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN3O14994 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN3O14994 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN3O14994 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN3O14994 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYN3O14994 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYN3O14994 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYN3O14994 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYN3O14994 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYN3O14994 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYN3O14994 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYN3O14994 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYN3O14994 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYN3O14994 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYN3O14994 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYN3O14994 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYN3O14994 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYN3O14994 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYN3O14994 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYN3O14994 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYN3O14994 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYN3O14994 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYN3O14994 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYN3O14994 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYN3O14994 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYN3O14994 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYN3O14994 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYN3O14994 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN3O14994 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN3O14994 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN3O14994 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN3O14994 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYN3O14994 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYN3O14994 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.7 ms