Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDC80O14777 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDC80O14777 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDC80O14777 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDC80O14777 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDC80O14777 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDC80O14777 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDC80O14777 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDC80O14777 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDC80O14777 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDC80O14777 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDC80O14777 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDC80O14777 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDC80O14777 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDC80O14777 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDC80O14777 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDC80O14777 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDC80O14777 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDC80O14777 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDC80O14777 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDC80O14777 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDC80O14777 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDC80O14777 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDC80O14777 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDC80O14777 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NDC80O14777 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NDC80O14777 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDC80O14777 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDC80O14777 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDC80O14777 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDC80O14777 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NDC80O14777 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDC80O14777 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDC80O14777 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NDC80O14777 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDC80O14777 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDC80O14777 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDC80O14777 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDC80O14777 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDC80O14777 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDC80O14777 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDC80O14777 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NDC80O14777 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDC80O14777 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDC80O14777 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDC80O14777 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDC80O14777 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDC80O14777 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NDC80O14777 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDC80O14777 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDC80O14777 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDC80O14777 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDC80O14777 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDC80O14777 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDC80O14777 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDC80O14777 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDC80O14777 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDC80O14777 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDC80O14777 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDC80O14777 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDC80O14777 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDC80O14777 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDC80O14777 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDC80O14777 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDC80O14777 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDC80O14777 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDC80O14777 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDC80O14777 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDC80O14777 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDC80O14777 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDC80O14777 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDC80O14777 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDC80O14777 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDC80O14777 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDC80O14777 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDC80O14777 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDC80O14777 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDC80O14777 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDC80O14777 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDC80O14777 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDC80O14777 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDC80O14777 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDC80O14777 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDC80O14777 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDC80O14777 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NDC80O14777 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDC80O14777 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDC80O14777 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDC80O14777 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDC80O14777 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDC80O14777 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDC80O14777 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDC80O14777 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDC80O14777 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDC80O14777 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDC80O14777 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDC80O14777 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDC80O14777 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NDC80O14777 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDC80O14777 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms