Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PIK3C2BO00750 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PIK3C2BO00750 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PIK3C2BO00750 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PIK3C2BO00750 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PIK3C2BO00750 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIK3C2BO00750 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PIK3C2BO00750 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PIK3C2BO00750 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIK3C2BO00750 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PIK3C2BO00750 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms