Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEN1O00255 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEN1O00255 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEN1O00255 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEN1O00255 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEN1O00255 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEN1O00255 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEN1O00255 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEN1O00255 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEN1O00255 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEN1O00255 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEN1O00255 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEN1O00255 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEN1O00255 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEN1O00255 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEN1O00255 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEN1O00255 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEN1O00255 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEN1O00255 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEN1O00255 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEN1O00255 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEN1O00255 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEN1O00255 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEN1O00255 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MEN1O00255 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MEN1O00255 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEN1O00255 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MEN1O00255 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEN1O00255 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MEN1O00255 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEN1O00255 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEN1O00255 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEN1O00255 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEN1O00255 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEN1O00255 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEN1O00255 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEN1O00255 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEN1O00255 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEN1O00255 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEN1O00255 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MEN1O00255 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEN1O00255 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MEN1O00255 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEN1O00255 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEN1O00255 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEN1O00255 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEN1O00255 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEN1O00255 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEN1O00255 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEN1O00255 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEN1O00255 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEN1O00255 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEN1O00255 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEN1O00255 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MEN1O00255 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEN1O00255 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEN1O00255 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEN1O00255 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEN1O00255 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEN1O00255 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEN1O00255 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEN1O00255 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEN1O00255 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEN1O00255 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEN1O00255 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEN1O00255 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEN1O00255 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEN1O00255 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEN1O00255 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEN1O00255 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEN1O00255 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEN1O00255 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEN1O00255 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEN1O00255 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEN1O00255 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEN1O00255 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEN1O00255 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEN1O00255 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEN1O00255 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEN1O00255 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEN1O00255 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEN1O00255 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEN1O00255 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MEN1O00255 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEN1O00255 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MEN1O00255 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEN1O00255 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEN1O00255 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEN1O00255 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MEN1O00255 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEN1O00255 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEN1O00255 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms