Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BNX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNX3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BNX3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNX3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BNX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNX3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNX3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BNX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BNX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNX3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNX3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BNX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNX3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNX3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNX3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNX3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BNX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BNX3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BNX3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNX3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BNX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BNX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H3BNX3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BNX3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNX3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BNX3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNX3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNX3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BNX3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNX3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNX3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNX3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BNX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BNX3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNX3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNX3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNX3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNX3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BNX3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BNX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BNX3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BNX3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BNX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BNX3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BNX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BNX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BNX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BNX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BNX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BNX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BNX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BNX3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BNX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BNX3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BNX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BNX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BNX3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BNX3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BNX3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BNX3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BNX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BNX3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BNX3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BNX3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms