Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PROB1E7EW31 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PROB1E7EW31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PROB1E7EW31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PROB1E7EW31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PROB1E7EW31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PROB1E7EW31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROB1E7EW31 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms