Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HNRNPCL3B7ZW38 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HNRNPCL3B7ZW38 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HNRNPCL3B7ZW38 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNRNPCL3B7ZW38 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 415.6 ms