Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DGG1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DGG1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DGG1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DGG1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DGG1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DGG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DGG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DGG1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DGG1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DGG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DGG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DGG1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DGG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DGG1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DGG1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DGG1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DGG1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DGG1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DGG1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DGG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DGG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DGG1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DGG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DGG1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DGG1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DGG1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DGG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DGG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DGG1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DGG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DGG1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DGG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DGG1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B4DGG1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B4DGG1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DGG1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DGG1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DGG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DGG1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DGG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DGG1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DGG1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4DGG1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4DGG1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4DGG1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4DGG1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4DGG1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4DGG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4DGG1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4DGG1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4DGG1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4DGG1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4DGG1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4DGG1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4DGG1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4DGG1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4DGG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4DGG1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4DGG1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DGG1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DGG1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DGG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DGG1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DGG1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4DGG1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
B4DGG1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4DGG1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
B4DGG1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4DGG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4DGG1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4DGG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4DGG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
B4DGG1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4DGG1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
B4DGG1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
B4DGG1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4DGG1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4DGG1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DGG1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DGG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DGG1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DGG1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4DGG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4DGG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4DGG1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4DGG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4DGG1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4DGG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms