Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE1LA8MT33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1LA8MT33 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1LA8MT33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCE1LA8MT33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE1LA8MT33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms