Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC53A6NM62 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC53A6NM62 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC53A6NM62 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC53A6NM62 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC53A6NM62 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms