Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN24A6NM45 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN24A6NM45 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN24A6NM45 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN24A6NM45 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms