Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ARID3CA6NKF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
ARID3CA6NKF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ARID3CA6NKF2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARID3CA6NKF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
ARID3CA6NKF2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ARID3CA6NKF2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ARID3CA6NKF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ARID3CA6NKF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ARID3CA6NKF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms