Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRAMEF22A3QJZ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PRAMEF22A3QJZ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PRAMEF22A3QJZ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRAMEF22A3QJZ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRAMEF22A3QJZ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms