Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JMD5

PRAMEF33, PRAME family member 33, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms