Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0B4J293 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0B4J293 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0B4J293 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J293 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms