Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WXM4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087WXM4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A087WXM4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A087WXM4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087WXM4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms