Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RUNX1Q01196 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms