Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00205P59089 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms