Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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