RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397750.7

ST7-OT4-201, ST7 overlapping transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ST7-OT4, Length 1,576 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST7-OT4-201ENST00000397750 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.33■■■■■ 4.85
ST7-OT4-201ENST00000397750 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.62■■■■□ 3.93
ST7-OT4-201ENST00000397750 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
ST7-OT4-201ENST00000397750 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.56■■■■□ 3.6
ST7-OT4-201ENST00000397750 ABCC9O60706 1549 aa37.14■■■■□ 3.54
ST7-OT4-201ENST00000397750 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.11■■■■□ 3.53
ST7-OT4-201ENST00000397750 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.09■■■■□ 3.53
ST7-OT4-201ENST00000397750 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.82■■■■□ 3.49
ST7-OT4-201ENST00000397750 NACADO15069 1562 aa36.79■■■■□ 3.48
ST7-OT4-201ENST00000397750 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.44■■■■□ 3.42
ST7-OT4-201ENST00000397750 SCRIBQ14160 1630 aa36.29■■■■□ 3.4
ST7-OT4-201ENST00000397750 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.87■■■■□ 3.33
ST7-OT4-201ENST00000397750 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
ST7-OT4-201ENST00000397750 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.37■■■■□ 3.25
ST7-OT4-201ENST00000397750 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.15■■■■□ 3.22
ST7-OT4-201ENST00000397750 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
ST7-OT4-201ENST00000397750 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
ST7-OT4-201ENST00000397750 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.99■■■■□ 3.19
ST7-OT4-201ENST00000397750 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.96■■■■□ 3.19
ST7-OT4-201ENST00000397750 SMARCA4P51532 1647 aa34.86■■■■□ 3.17
ST7-OT4-201ENST00000397750 WIZO95785 1651 aa34.77■■■■□ 3.16
ST7-OT4-201ENST00000397750 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.49■■■■□ 3.11
ST7-OT4-201ENST00000397750 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
ST7-OT4-201ENST00000397750 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
ST7-OT4-201ENST00000397750 SMARCA2P51531 1590 aa34.22■■■■□ 3.07
ST7-OT4-201ENST00000397750 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.2■■■■□ 3.07
ST7-OT4-201ENST00000397750 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.07■■■■□ 3.05
ST7-OT4-201ENST00000397750 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
ST7-OT4-201ENST00000397750 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.99■■■■□ 3.03
ST7-OT4-201ENST00000397750 HMGXB3Q12766 1538 aa33.94■■■■□ 3.02
ST7-OT4-201ENST00000397750 NCAPD3P42695 1498 aa33.91■■■■□ 3.02
ST7-OT4-201ENST00000397750 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.73■■■□□ 2.99
ST7-OT4-201ENST00000397750 TRIM41Q8WV44 630 aa33.36■■■□□ 2.93
ST7-OT4-201ENST00000397750 ABCC8Q09428 1581 aa33.31■■■□□ 2.92
ST7-OT4-201ENST00000397750 PRDM2Q13029 1718 aa33.24■■■□□ 2.91
ST7-OT4-201ENST00000397750 CFTRP13569 1480 aa33.18■■■□□ 2.9
ST7-OT4-201ENST00000397750 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.06■■■□□ 2.88
ST7-OT4-201ENST00000397750 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.99■■■□□ 2.87
ST7-OT4-201ENST00000397750 SYNJ1O43426 1573 aa32.99■■■□□ 2.87
ST7-OT4-201ENST00000397750 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.9■■■□□ 2.86
ST7-OT4-201ENST00000397750 TOP2BQ02880 1626 aa32.88■■■□□ 2.85
ST7-OT4-201ENST00000397750 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.79■■■□□ 2.84
ST7-OT4-201ENST00000397750 CUX1P39880 1505 aa32.72■■■□□ 2.83
ST7-OT4-201ENST00000397750 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.7■■■□□ 2.82
ST7-OT4-201ENST00000397750 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.68■■■□□ 2.82
ST7-OT4-201ENST00000397750 EEA1Q15075 1411 aa32.67■■■□□ 2.82
ST7-OT4-201ENST00000397750 NESP48681 1621 aa32.67■■■□□ 2.82
ST7-OT4-201ENST00000397750 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
ST7-OT4-201ENST00000397750 SOGA1O94964 1423 aa32.65■■■□□ 2.82
ST7-OT4-201ENST00000397750 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.64■■■□□ 2.82
ST7-OT4-201ENST00000397750 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.55■■■□□ 2.8
ST7-OT4-201ENST00000397750 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.45■■■□□ 2.78
ST7-OT4-201ENST00000397750 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.43■■■□□ 2.78
ST7-OT4-201ENST00000397750 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.43■■■□□ 2.78
ST7-OT4-201ENST00000397750 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.42■■■□□ 2.78
ST7-OT4-201ENST00000397750 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.38■■■□□ 2.77
ST7-OT4-201ENST00000397750 TOPBP1Q92547 1522 aa32.34■■■□□ 2.77
ST7-OT4-201ENST00000397750 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.33■■■□□ 2.77
ST7-OT4-201ENST00000397750 KIF21BO75037 1637 aa32.32■■■□□ 2.77
ST7-OT4-201ENST00000397750 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
ST7-OT4-201ENST00000397750 KIF27Q86VH2 1401 aa32.21■■■□□ 2.75
ST7-OT4-201ENST00000397750 GOLGA3Q08378 1498 aa32.2■■■□□ 2.75
ST7-OT4-201ENST00000397750 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
ST7-OT4-201ENST00000397750 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.14■■■□□ 2.74
ST7-OT4-201ENST00000397750 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.11■■■□□ 2.73
ST7-OT4-201ENST00000397750 WDR97A6NE52 1622 aa32.11■■■□□ 2.73
ST7-OT4-201ENST00000397750 CUX2O14529 1486 aa32.09■■■□□ 2.73
ST7-OT4-201ENST00000397750 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.09■■■□□ 2.73
ST7-OT4-201ENST00000397750 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.07■■■□□ 2.73
ST7-OT4-201ENST00000397750 PRXQ9BXM0 1461 aa32.07■■■□□ 2.72
ST7-OT4-201ENST00000397750 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.04■■■□□ 2.72
ST7-OT4-201ENST00000397750 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.02■■■□□ 2.72
ST7-OT4-201ENST00000397750 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32■■■□□ 2.71
ST7-OT4-201ENST00000397750 WDR62O43379 1518 aa31.93■■■□□ 2.7
ST7-OT4-201ENST00000397750 CEP162Q5TB80 1403 aa31.92■■■□□ 2.7
ST7-OT4-201ENST00000397750 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
ST7-OT4-201ENST00000397750 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
ST7-OT4-201ENST00000397750 IGF1RP08069 1367 aa31.9■■■□□ 2.7
ST7-OT4-201ENST00000397750 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.88■■■□□ 2.69
ST7-OT4-201ENST00000397750 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
ST7-OT4-201ENST00000397750 ERCC6Q03468 1493 aa31.82■■■□□ 2.68
ST7-OT4-201ENST00000397750 CUL7Q14999 1698 aa31.8■■■□□ 2.68
ST7-OT4-201ENST00000397750 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.73■■■□□ 2.67
ST7-OT4-201ENST00000397750 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.69■■■□□ 2.66
ST7-OT4-201ENST00000397750 IFT140Q96RY7 1462 aa31.66■■■□□ 2.66
ST7-OT4-201ENST00000397750 PBRM1Q86U86 1689 aa31.66■■■□□ 2.66
ST7-OT4-201ENST00000397750 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
ST7-OT4-201ENST00000397750 CLIP1P30622 1438 aa31.65■■■□□ 2.66
ST7-OT4-201ENST00000397750 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.51■■■□□ 2.63
ST7-OT4-201ENST00000397750 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.63
ST7-OT4-201ENST00000397750 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
ST7-OT4-201ENST00000397750 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
ST7-OT4-201ENST00000397750 GRIN2BQ13224 1484 aa31.44■■■□□ 2.62
ST7-OT4-201ENST00000397750 ADAMTS12P58397 1594 aa31.43■■■□□ 2.62
ST7-OT4-201ENST00000397750 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.42■■■□□ 2.62
ST7-OT4-201ENST00000397750 ARAP1Q96P48 1450 aa31.39■■■□□ 2.62
ST7-OT4-201ENST00000397750 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.36■■■□□ 2.61
ST7-OT4-201ENST00000397750 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.36■■■□□ 2.61
ST7-OT4-201ENST00000397750 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
ST7-OT4-201ENST00000397750 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1610.9 ms