Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 YKU70YMR284W 1809 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 BRE1YDL074C 2103 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 snR85snR85 171 nt2.31□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 SDH6YDR379C-A 240 nt2.31□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YGL024WYGL024W 336 nt2.31□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YIL032CYIL032C 357 nt2.31□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YIL102CYIL102C 306 nt2.31□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 NUP170YBL079W 4509 nt2.31□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 ALK2YBL009W 2031 nt2.3□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 NEO1YIL048W 3456 nt2.3□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 VMR1YHL035C 4779 nt2.3□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 STB4YMR019W 2850 nt2.3□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.3□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 VMA9YCL005W-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 SCW11YGL028C 1629 nt2.29□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 PRE4YFR050C 801 nt2.29□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 GPG1YGL121C 381 nt2.29□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 SMY1YKL079W 1971 nt2.29□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 PRP39YML046W 1890 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YDR341CYDR341C 1824 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 COG8YML071C 1824 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 MNL2YLR057W 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 BUD2YKL092C 3315 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 RGA1YOR127W 3024 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 BNI1YNL271C 5862 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 SNF5YBR289W 2718 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 SCH9YHR205W 2475 nt2.28□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YLR149CYLR149C 2193 nt2.27□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 MDM20YOL076W 2391 nt2.27□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 snR55snR55 98 nt2.27□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 PAU2YEL049W 363 nt2.27□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.27□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.27□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 SYH1YPL105C 2550 nt2.27□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 AIM9YER080W 1884 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 USO1YDL058W 5373 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 RPL37BYDR500C 267 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 QCR7YDR529C 384 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 VTC1YER072W 390 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 HSK3YKL138C-A 210 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YOR015WYOR015W 360 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 snR48snR48 113 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 SET2YJL168C 2202 nt2.26□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.25□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 SAR1YPL218W 573 nt2.25□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YBR224WYBR224W 516 nt2.25□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 UBP1YDL122W 2430 nt2.25□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 PET309YLR067C 2898 nt2.24□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 CAT2YML042W 2013 nt2.24□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YHL041WYHL041W 450 nt2.24□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YHL042WYHL042W 453 nt2.24□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 PHS1YJL097W 654 nt2.24□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.24□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 NAM7YMR080C 2916 nt2.24□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 CHC1YGL206C 4962 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 PEP3YLR148W 2757 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 COS111YBR203W 2775 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 ATG9YDL149W 2994 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 SPP41YDR464W 4308 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 snR60snR60 104 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YGL052WYGL052W 306 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 TIM13YGR181W 318 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 UPS1YLR193C 528 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YPL182CYPL182C 384 nt2.23□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 GUP1YGL084C 1683 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 RPH1YER169W 2391 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 RBK1YCR036W 1002 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 BRP1YGL007W 378 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YGL239CYGL239C 315 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 YLR140WYLR140W 327 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 CYB5YNL111C 363 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 SLM1YIL105C 2061 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 HER1YOR227W 3741 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 DOT6YER088C 2013 nt2.22□□□□□ -2.05
NEW1Q08972 ZRG8YER033C 3231 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 VIK1YPL253C 1944 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YIL059CYIL059C 366 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YMR321CYMR321C 318 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YBL083CYBL083C 426 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YBR184WYBR184W 1572 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 RIM20YOR275C 1986 nt2.21□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YDL118WYDL118W 381 nt2.2□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YPR063CYPR063C 423 nt2.2□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 STH1YIL126W 4080 nt2.2□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 PDR8YLR266C 2106 nt2.19□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.19□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 HHT1YBR010W 411 nt2.19□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 HDA3YPR179C 1968 nt2.19□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 FKS1YLR342W 5631 nt2.19□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 PLC1YPL268W 2610 nt2.19□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.18□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.18□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 NOP14YDL148C 2433 nt2.17□□□□□ -2.06
NEW1Q08972 YCR043CYCR043C 384 nt2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.9 ms