Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
WDR53Q7Z5U6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
WDR53Q7Z5U6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
WDR53Q7Z5U6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
WDR53Q7Z5U6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
WDR53Q7Z5U6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
WDR53Q7Z5U6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
WDR53Q7Z5U6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms