Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 SYH1YPL105C 2550 nt2.22□□□□□ -2.05
PUS4P48567 VPS8YAL002W 3825 nt2.22□□□□□ -2.05
PUS4P48567 SEC26YDR238C 2922 nt2.21□□□□□ -2.05
PUS4P48567 SWI6YLR182W 2412 nt2.21□□□□□ -2.06
PUS4P48567 RKM1YPL208W 1752 nt2.21□□□□□ -2.06
PUS4P48567 PEX4YGR133W 552 nt2.21□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.21□□□□□ -2.06
PUS4P48567 NUP170YBL079W 4509 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 HDA3YPR179C 1968 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 RPH1YER169W 2391 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 CSN9YDR179C 489 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YER097WYER097W 330 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 PRE4YFR050C 801 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 TMA10YLR327C 261 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 CYB5YNL111C 363 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YOL098CYOL098C 3114 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 UBP15YMR304W 3693 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 MSB2YGR014W 3921 nt2.2□□□□□ -2.06
PUS4P48567 TFC8YPL007C 1767 nt2.19□□□□□ -2.06
PUS4P48567 ARP8YOR141C 2646 nt2.19□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YDR008CYDR008C 351 nt2.19□□□□□ -2.06
PUS4P48567 NOP53YPL146C 1368 nt2.19□□□□□ -2.06
PUS4P48567 MSH6YDR097C 3729 nt2.19□□□□□ -2.06
PUS4P48567 HER1YOR227W 3741 nt2.19□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YOR296WYOR296W 3870 nt2.18□□□□□ -2.06
PUS4P48567 RPL35AYDL191W 363 nt2.18□□□□□ -2.06
PUS4P48567 BRP1YGL007W 378 nt2.18□□□□□ -2.06
PUS4P48567 MAM33YIL070C 801 nt2.18□□□□□ -2.06
PUS4P48567 MCM22YJR135C 720 nt2.18□□□□□ -2.06
PUS4P48567 SVL3YPL032C 2478 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YPL150WYPL150W 2706 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 CYC7YEL039C 342 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 FMP23YBR047W 528 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YCL046WYCL046W 324 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 MYO4YAL029C 4416 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 UBP1YDL122W 2430 nt2.17□□□□□ -2.06
PUS4P48567 DCP2YNL118C 2913 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS4P48567 PLC1YPL268W 2610 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS4P48567 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS4P48567 UPS1YLR193C 528 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS4P48567 PXA2YKL188C 2562 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS4P48567 OSH6YKR003W 1347 nt2.16□□□□□ -2.06
PUS4P48567 PAU18YLL064C 363 nt2.15□□□□□ -2.07
PUS4P48567 PAU6YNR076W 363 nt2.15□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YOP1YPR028W 543 nt2.15□□□□□ -2.07
PUS4P48567 IRE1YHR079C 3348 nt2.15□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.14□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.14□□□□□ -2.07
PUS4P48567 HTB2YBL002W 396 nt2.14□□□□□ -2.07
PUS4P48567 IST2YBR086C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
PUS4P48567 SSQ1YLR369W 1974 nt2.14□□□□□ -2.07
PUS4P48567 CAT2YML042W 2013 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YPL216WYPL216W 3309 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YDR048CYDR048C 315 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 EMP24YGL200C 612 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 NUP120YKL057C 3114 nt2.13□□□□□ -2.07
PUS4P48567 SAP185YJL098W 3177 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 PDR3YBL005W 2931 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 ARP7YPR034W 1434 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YER181CYER181C 324 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 RPB10YOR210W 213 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 NUT2YPR168W 474 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 HCS1YKL017C 2052 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 RTT107YHR154W 3213 nt2.12□□□□□ -2.07
PUS4P48567 RIM20YOR275C 1986 nt2.11□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YDR426CYDR426C 378 nt2.11□□□□□ -2.07
PUS4P48567 RPL39YJL189W 156 nt2.11□□□□□ -2.07
PUS4P48567 TAR1YLR154W-C 375 nt2.11□□□□□ -2.07
PUS4P48567 STE5YDR103W 2754 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 DNA2YHR164C 4569 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 SLY1YDR189W 2001 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YDL118WYDL118W 381 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 snR51snR51 107 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 CFT2YLR115W 2580 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 YPR097WYPR097W 3222 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 MCD1YDL003W 1701 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 ZIP1YDR285W 2628 nt2.1□□□□□ -2.07
PUS4P48567 MMS22YLR320W 4365 nt2.09□□□□□ -2.07
PUS4P48567 FRK1YPL141C 2598 nt2.09□□□□□ -2.07
PUS4P48567 MAK10YEL053C 2202 nt2.09□□□□□ -2.08
PUS4P48567 SSD1YDR293C 3753 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 LYS14YDR034C 2373 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 NOP14YDL148C 2433 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 RFX1YLR176C 2436 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 ZRG17YNR039C 1818 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 MUK1YPL070W 1839 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 PTP3YER075C 2787 nt2.08□□□□□ -2.08
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