Protein–RNA interactions for Protein: P40479

SDP1, Dual-specificity protein phosphatase SDP1, yeastyeast

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDP1P40479 YLR255CYLR255C 354 nt2.65□□□□□ -1.99
SDP1P40479 ATP8Q0080 147 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 CSE2YNR010W 450 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SLH1YGR271W 5904 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 EFR3YMR212C 2349 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 FIR1YER032W 2631 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 RAX2YLR084C 3663 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 ATG13YPR185W 2217 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 VPH1YOR270C 2523 nt2.64□□□□□ -1.99
SDP1P40479 TFC4YGR047C 3078 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 GCV2YMR189W 3105 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 MDM20YOL076W 2391 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 TRX1YLR043C 312 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YMR321CYMR321C 318 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 TAE2YPL009C 3117 nt2.63□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SEF1YBL066C 3447 nt2.62□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YBR184WYBR184W 1572 nt2.62□□□□□ -1.99
SDP1P40479 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.62□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.62□□□□□ -1.99
SDP1P40479 LCD1YDR499W 2244 nt2.62□□□□□ -1.99
SDP1P40479 TAO3YIL129C 7131 nt2.62□□□□□ -1.99
SDP1P40479 NOP53YPL146C 1368 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YLR149CYLR149C 2193 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 CFT2YLR115W 2580 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SIN3YOL004W 4611 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 ECM21YBL101C 3354 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YOR015WYOR015W 360 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YPR203WYPR203W 309 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 VPS34YLR240W 2628 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 MDM1YML104C 3384 nt2.61□□□□□ -1.99
SDP1P40479 RTT10YPL183C 3042 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 HSC82YMR186W 2118 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SDC25YLL016W 3147 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 VIK1YPL253C 1944 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SMY1YKL079W 1971 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SNF5YBR289W 2718 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SSS1YDR086C 243 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 ERP6YGL002W 651 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 SUL1YBR294W 2580 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 VPS16YPL045W 2397 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 COS111YBR203W 2775 nt2.6□□□□□ -1.99
SDP1P40479 ILS1YBL076C 3219 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 ATG26YLR189C 3597 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YGR067CYGR067C 2415 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 ESL1YIL151C 3357 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 PEP3YLR148W 2757 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 GRR1YJR090C 3456 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 DYN2YDR424C 279 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 PAU10YDR542W 363 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YEL014CYEL014C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 PAU11YGL261C 363 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 PAU4YLR461W 363 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 CRS5YOR031W 210 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 YBR277CYBR277C 402 nt2.59□□□□□ -1.99
SDP1P40479 MET6YER091C 2304 nt2.59□□□□□ -2
SDP1P40479 YIL169CYIL169C 2988 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 YDR186CYDR186C 2634 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 RGA2YDR379W 3030 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 GEA1YJR031C 4227 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 SSQ1YLR369W 1974 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 RIC1YLR039C 3171 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 TRS65YGR166W 1683 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 RCY1YJL204C 2523 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 ACB1YGR037C 264 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 YJL150WYJL150W 303 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 VPS55YJR044C 423 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 RPS12YOR369C 432 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 UTP14YML093W 2700 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 KAP123YER110C 3342 nt2.58□□□□□ -2
SDP1P40479 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.57□□□□□ -2
SDP1P40479 CDC27YBL084C 2277 nt2.57□□□□□ -2
SDP1P40479 YRB1YDR002W 606 nt2.57□□□□□ -2
SDP1P40479 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.57□□□□□ -2
SDP1P40479 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.57□□□□□ -2
SDP1P40479 PDE2YOR360C 1581 nt2.57□□□□□ -2
SDP1P40479 CYR1YJL005W 6081 nt2.56□□□□□ -2
SDP1P40479 INA22YIR024C 651 nt2.56□□□□□ -2
SDP1P40479 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.56□□□□□ -2
SDP1P40479 RPL33AYPL143W 324 nt2.56□□□□□ -2
SDP1P40479 PXA2YKL188C 2562 nt2.56□□□□□ -2
SDP1P40479 PLC1YPL268W 2610 nt2.56□□□□□ -2
SDP1P40479 JSN1YJR091C 3276 nt2.56□□□□□ -2
SDP1P40479 AFI1YOR129C 2682 nt2.55□□□□□ -2
SDP1P40479 INP52YNL106C 3552 nt2.55□□□□□ -2
SDP1P40479 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.55□□□□□ -2
SDP1P40479 OLI1Q0130 231 nt2.55□□□□□ -2
SDP1P40479 SNC1YAL030W 354 nt2.55□□□□□ -2
SDP1P40479 YOR170WYOR170W 306 nt2.55□□□□□ -2
SDP1P40479 SPT21YMR179W 2277 nt2.54□□□□□ -2
SDP1P40479 SWR1YDR334W 4545 nt2.54□□□□□ -2
SDP1P40479 SPO22YIL073C 2928 nt2.54□□□□□ -2
SDP1P40479 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.54□□□□□ -2
SDP1P40479 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.54□□□□□ -2
SDP1P40479 RPL42BYHR141C 321 nt2.54□□□□□ -2
SDP1P40479 YJL135WYJL135W 318 nt2.54□□□□□ -2
SDP1P40479 RPL42AYNL162W 321 nt2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.3 ms