Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KRW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KRW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KRW8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KRW8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KRW8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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