Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDKN3Q16667 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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