Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC62Q6P9F0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC62Q6P9F0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms