RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330070.5

HOXB2-201, Transcript of homeobox B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB2, Length 1,562 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2-201ENST00000330070 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.58■■■■■ 5.37
HOXB2-201ENST00000330070 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.26■■■■■ 4.52
HOXB2-201ENST00000330070 ABCC9O60706 1549 aa42.19■■■■■ 4.34
HOXB2-201ENST00000330070 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
HOXB2-201ENST00000330070 NACADO15069 1562 aa40.69■■■■■ 4.1
HOXB2-201ENST00000330070 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.51■■■■■ 4.08
HOXB2-201ENST00000330070 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
HOXB2-201ENST00000330070 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.44■■■■■ 4.06
HOXB2-201ENST00000330070 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.3■■■■■ 4.04
HOXB2-201ENST00000330070 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.69■■■■□ 3.94
HOXB2-201ENST00000330070 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.4■■■■□ 3.9
HOXB2-201ENST00000330070 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.38■■■■□ 3.89
HOXB2-201ENST00000330070 SCRIBQ14160 1630 aa39.34■■■■□ 3.89
HOXB2-201ENST00000330070 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.19■■■■□ 3.86
HOXB2-201ENST00000330070 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXB2-201ENST00000330070 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
HOXB2-201ENST00000330070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.22■■■■□ 3.71
HOXB2-201ENST00000330070 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.98■■■■□ 3.67
HOXB2-201ENST00000330070 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
HOXB2-201ENST00000330070 SMARCA4P51532 1647 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXB2-201ENST00000330070 NCAPD3P42695 1498 aa37.52■■■■□ 3.6
HOXB2-201ENST00000330070 SMARCA2P51531 1590 aa37.51■■■■□ 3.6
HOXB2-201ENST00000330070 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.5■■■■□ 3.59
HOXB2-201ENST00000330070 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.4■■■■□ 3.58
HOXB2-201ENST00000330070 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.38■■■■□ 3.57
HOXB2-201ENST00000330070 HMGXB3Q12766 1538 aa37.35■■■■□ 3.57
HOXB2-201ENST00000330070 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
HOXB2-201ENST00000330070 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
HOXB2-201ENST00000330070 WIZO95785 1651 aa36.95■■■■□ 3.51
HOXB2-201ENST00000330070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
HOXB2-201ENST00000330070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.55■■■■□ 3.44
HOXB2-201ENST00000330070 NESP48681 1621 aa36.48■■■■□ 3.43
HOXB2-201ENST00000330070 ERCC6Q03468 1493 aa36.44■■■■□ 3.42
HOXB2-201ENST00000330070 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.41■■■■□ 3.42
HOXB2-201ENST00000330070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB2-201ENST00000330070 CFTRP13569 1480 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXB2-201ENST00000330070 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB2-201ENST00000330070 CUX2O14529 1486 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB2-201ENST00000330070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB2-201ENST00000330070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
HOXB2-201ENST00000330070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXB2-201ENST00000330070 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.94■■■■□ 3.34
HOXB2-201ENST00000330070 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXB2-201ENST00000330070 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
HOXB2-201ENST00000330070 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB2-201ENST00000330070 WDR62O43379 1518 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXB2-201ENST00000330070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
HOXB2-201ENST00000330070 ABCC8Q09428 1581 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXB2-201ENST00000330070 TOPBP1Q92547 1522 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB2-201ENST00000330070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.37■■■■□ 3.25
HOXB2-201ENST00000330070 IFT140Q96RY7 1462 aa35.21■■■■□ 3.23
HOXB2-201ENST00000330070 CUX1P39880 1505 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXB2-201ENST00000330070 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
HOXB2-201ENST00000330070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
HOXB2-201ENST00000330070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXB2-201ENST00000330070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXB2-201ENST00000330070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
HOXB2-201ENST00000330070 SOGA1O94964 1423 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXB2-201ENST00000330070 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
HOXB2-201ENST00000330070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXB2-201ENST00000330070 WDR97A6NE52 1622 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXB2-201ENST00000330070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
HOXB2-201ENST00000330070 TOP2BQ02880 1626 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB2-201ENST00000330070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXB2-201ENST00000330070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.75■■■■□ 3.157e-12■■□□□ 14.3
HOXB2-201ENST00000330070 SYNJ1O43426 1573 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB2-201ENST00000330070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXB2-201ENST00000330070 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
HOXB2-201ENST00000330070 OSCARQ8IYS5 282 aa34.57■■■■□ 3.13
HOXB2-201ENST00000330070 GRIN2BQ13224 1484 aa34.57■■■■□ 3.12
HOXB2-201ENST00000330070 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXB2-201ENST00000330070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB2-201ENST00000330070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
HOXB2-201ENST00000330070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.47■■■■□ 3.11
HOXB2-201ENST00000330070 PBRM1Q86U86 1689 aa34.45■■■■□ 3.1
HOXB2-201ENST00000330070 CHD1O14646 1710 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXB2-201ENST00000330070 SYNJ2O15056 1496 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXB2-201ENST00000330070 FBLN2P98095 1184 aa34.32■■■■□ 3.08
HOXB2-201ENST00000330070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXB2-201ENST00000330070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXB2-201ENST00000330070 ADAMTS12P58397 1594 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXB2-201ENST00000330070 KIF27Q86VH2 1401 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXB2-201ENST00000330070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXB2-201ENST00000330070 GRIN2AQ12879 1464 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXB2-201ENST00000330070 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.08■■■■□ 3.05
HOXB2-201ENST00000330070 IGF1RP08069 1367 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXB2-201ENST00000330070 TRIM41Q8WV44 630 aa34.01■■■■□ 3.03
HOXB2-201ENST00000330070 ARHGEF11O15085 1522 aa34■■■■□ 3.03
HOXB2-201ENST00000330070 CUL7Q14999 1698 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXB2-201ENST00000330070 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXB2-201ENST00000330070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXB2-201ENST00000330070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXB2-201ENST00000330070 NUP160Q12769 1436 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXB2-201ENST00000330070 CEP170Q5SW79 1584 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXB2-201ENST00000330070 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.82■■■■□ 3
HOXB2-201ENST00000330070 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.73■■■□□ 2.99
HOXB2-201ENST00000330070 SHROOM2Q13796 1616 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXB2-201ENST00000330070 ARAP1Q96P48 1450 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXB2-201ENST00000330070 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXB2-201ENST00000330070 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.64■■■□□ 2.98
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