Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 GRX8YLR364W 330 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YNL010WYNL010W 726 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 ATP19YOL077W-A 207 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SEC16YPL085W 6588 nt2.38□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SAP185YJL098W 3177 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 CDC60YPL160W 3273 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RTR2YDR066C 591 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RPL9AYGL147C 576 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RPF1YHR088W 888 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SPC1YJR010C-A 285 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 GPI15YNL038W 690 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 KIP1YBL063W 3336 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SIR4YDR227W 4077 nt2.37□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 HOP2YGL033W 657 nt2.36□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RPL16AYIL133C 600 nt2.36□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.36□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 AIM32YML050W 936 nt2.36□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YPL197CYPL197C 414 nt2.36□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 MSS18YPR134W 807 nt2.36□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SOK2YMR016C 2358 nt2.36□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RTT107YHR154W 3213 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 RGA1YOR127W 3024 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 CHC1YGL206C 4962 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 DAD4YDR320C-A 219 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 ANS1YHR126C 480 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YKL044WYKL044W 321 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 MRPL44YMR225C 297 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SPC29YPL124W 762 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 ALK2YBL009W 2031 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 SPC72YAL047C 1869 nt2.35□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 IRC8YJL051W 2469 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 MCD1YDL003W 1701 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 MGM1YOR211C 2646 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 GYP5YPL249C 2685 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YDL068WYDL068W 330 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 VOA1YGR106C 798 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 NUP82YJL061W 2142 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 ROX1YPR065W 1107 nt2.34□□□□□ -2.03
RTP1Q12751 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.34□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 KOG1YHR186C 4674 nt2.34□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 VPS13YLL040C 9435 nt2.33□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YGR045CYGR045C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.33□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 DDR48YMR173W 1293 nt2.33□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 NOP14YDL148C 2433 nt2.33□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 CRM1YGR218W 3255 nt2.33□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YDR286CYDR286C 345 nt2.32□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 MXR1YER042W 555 nt2.32□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 PBI2YNL015W 228 nt2.32□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 NOP15YNL110C 663 nt2.32□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 SPO22YIL073C 2928 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 SPP41YDR464W 4308 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 COS111YBR203W 2775 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YCR001WYCR001W 315 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YAP3YHL009C 993 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 RPI1YIL119C 1224 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YLR053CYLR053C 327 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YDR341CYDR341C 1824 nt2.31□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YOL098CYOL098C 3114 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 SMB1YER029C 591 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 VAR1Q0140 1197 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YHR130CYHR130C 336 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 NCE101YJL205C 162 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 RTC6YPL183W-A 282 nt2.3□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YMR045CYMR045C 5268 nt2.29□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 VMR1YHL035C 4779 nt2.29□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 HER1YOR227W 3741 nt2.29□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 RPL37BYDR500C 267 nt2.29□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YKL111CYKL111C 336 nt2.29□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 CAT2YML042W 2013 nt2.29□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YJR157WYJR157W 363 nt2.28□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 PKR1YMR123W 369 nt2.28□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 SNC2YOR327C 348 nt2.28□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 SYH1YPL105C 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
RTP1Q12751 YJL016WYJL016W 1686 nt2.28□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 TFC3YAL001C 3483 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 NAM7YMR080C 2916 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 COX13YGL191W 390 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 TEN1YLR010C 483 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YML084WYML084W 309 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 CTK3YML112W 891 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YMR324CYMR324C 243 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YPL205CYPL205C 345 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 IRC16YPR038W 360 nt2.27□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 RIC1YLR039C 3171 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 PET309YLR067C 2898 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 VPS35YJL154C 2835 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 RMP1YLR145W 606 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 SEN15YMR059W 387 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 TOM22YNL131W 459 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 SSD1YDR293C 3753 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 PDR8YLR266C 2106 nt2.26□□□□□ -2.05
RTP1Q12751 YDL062WYDL062W 426 nt2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.6 ms